1. アイテム引き継ぎ
   クリアデータで開始するとクリア時に持っていたアタッシュケースの中身すべてと、所持していたお金を引き継げる。また、開始時に武器の購入、改造が出来ます。ただし、同じ難易度しか引き継ぎは出来ません。例えば、NORMALでクリアしてプロフェッショナルに引き継ぐといったことは出来ません。
   
2. コスチューム追加
   スペシャルコスチューム1が追加される。本編で選択可能です。
   
3. ハンドガン(マチルダ)
   ハンドガン(マチルダ)が買えるようになる。３ショットバースト可能で、価格は70000PTASです。
   
4. 無限ロケットランチャー
   弾無限ロケットランチャーが買えるようになる。価格は100万PTASです。
   
5. ADA THE SPY
   「ADA THE SPY」が出来るようになる。エイダでプレイし、寄生虫のサンプルを５個回収してヘリで脱出します。最後にはクラウザーが立ちはだかりますが、一定ダメージを与えると逃げていきます。これをクリアするとシカゴタイプライター（弾無限マシンガン）がクリアデータで始めた時に買えるようになります。ただし、こちらも価格は100万です。
   
6. THE MERCENARIES
   「THE MERCENARIES」がプレイできるようになる。４つのステージから１つ選び、制限時間内にどれだけ多くのガナード（敵）を倒し、ポイントを得られるかというゲームです。
   初めはレオンしか使用できませんが、ハイスコアを出すとエイダなどのキャラが使用できるようになります
   
7. 難易度「PROFESSIONAL」
   NORMALモードをクリアすると、PROFESSIONALという、さらに難しい難易度が出てきます。本編で選択可能です。

本編クリア後に特典として出てくるミニゲーム「THE MERCENARIES」を全てのキャラクターで全てのステージを星５つでクリアすると、本編で武器商人からハンドキャノンを貰うことが出来ます。

本編クリア後に特典として出てくるミニゲーム「Ada the Spy」をクリアすると、本編で武器商人から1000000PTASでシカゴタイプライターを買うことが出来るようになります。